关于 AquaVir-KB

水生无脊椎动物病毒知识库 — Aquatic Invertebrate Virus Knowledge Base

项目简介

AquaVir-KB 是全球首个专门覆盖水生无脊椎动物病毒的综合知识库。数据库整合了病毒分类学、宿主关联、文献证据、蛋白质功能注释、地理分布和系统发育等多维度数据，覆盖节肢动物、软体动物、刺胞动物、棘皮动物、海绵动物、环节动物、线虫动物、扁形动物和轮虫动物九大宿主门，收录超过 3,500 种病毒和 17,000 余分离株。

前身为 CrustaVirus DB v1（甲壳动物病毒数据库），2026年扩展为全水生无脊椎动物病毒知识库。

数据引用

如果您在研究中使用了 AquaVir-KB 的数据，请引用：

[Citation information will be provided upon NAR 2028 publication]

数据使用条款

AquaVir-KB 数据遵循 CC BY 4.0 许可协议。您可以自由地：

  • 共享 — 复制和再分发数据
  • 改编 — 修改、转换和基于数据构建
  • 用于任何目的，包括商业用途

但必须：署名 — 给出适当的引用，提供许可链接，并注明是否进行了修改。

数据来源

NCBI GenBank
序列与分离株
UniProt
蛋白质注释
ICTV
病毒分类学
Europe PMC
文献全文
InterPro
蛋白结构域
GBIF / OBIS
宿主分布
AlphaFold / ESMFold
3D蛋白结构
KEGG / STRING
通路与互作

技术栈

后端: Python FastAPI + SQLite (目标迁移至 PostgreSQL)

前端: Jinja2 + Tailwind CSS + HTMX + ECharts

数据管线: ~60 个 Python 脚本 (NCBI / UniProt / InterPro / KEGG / EPMC / SRA)

部署: Docker Compose + Nginx + HTTPS

版本化: Zenodo DOI